Es gibt wie Oben schon erwähnt zwei verschiedene Haartypen dieser Rasse: Zum einen den Kurz- und zum anderen den Langhaar-Chihuahua. Der Kurzhaar-Chihuahua ist die Ursprungsrasse und besitzt kurze, weich und glänzende - glatt am Körper anliegende - Haare. Der langhaarige Chihuahua entstand erst durch die Einkreuzung von Papillons und kleinen Spitzen. Er hat ein weiches, seidiges, flach anliegendendes Fell. Außerdem besitzt er eine reich (federbuschartige) behaarte Rute, einen großen Kragen sowie Fransen an den Ohren und eine "Behosung" an den Hinterläufen. Wie bei kaum einer anderen Rasse, sind beim Chihuahua alle Fellfarben und Kombinationen außer Merle erlaubt.
Es gibt sie einfarbig mit Abzeichen, ebenso gescheckt. Man kennt sie in allen Braun- und Rottönen, in silberfarben, cremefarben, schokobraun, black and tan sowie schwarz, weiß oder tricolours (dreifarbig). Wie schon erwähnt, sind beim Chihuahua alle Fellfarben erlaubt. Grundsätzlich können auch alle Farbvariationen miteinander verpaart werden. Allerdings gibt es hier eine einzige Ausnahme: Nämlich BLAU in allen Nuancen und Farbkombinationen.